注: 任務(wù)不要重復(fù)多次提交,一次建議只運(yùn)行一個(gè)主流程任務(wù),多任務(wù)并行會(huì)導(dǎo)致卡頓,以至運(yùn)行失敗。一般正常任務(wù) 一天之內(nèi)能夠分析完成,如一天之后還沒(méi)運(yùn)行完成,可能就是任務(wù)失敗了,需要聯(lián)系后臺(tái)人員查看報(bào)錯(cuò)原因處理。
]]>進(jìn)入項(xiàng)目管理 – 我的項(xiàng)目 – 打開(kāi)對(duì)應(yīng)的項(xiàng)目
上述報(bào)告查找頁(yè)面 – 打開(kāi)報(bào)告之后 – 點(diǎn)擊報(bào)告右上角 – 項(xiàng)目結(jié)果下載 – 選擇下載結(jié)果數(shù)據(jù)
結(jié)果數(shù)據(jù)較小的直接使用瀏覽器下載,較大的需要使用 ftp 下載,具體的 ftp下載指導(dǎo)在后續(xù)詳細(xì)介紹。
我們對(duì)于不同的產(chǎn)品對(duì)應(yīng)了不同的編號(hào)加以區(qū)分,詳細(xì)如下:
報(bào)告/任務(wù)編號(hào)對(duì)應(yīng)產(chǎn)品類(lèi)型:
微生物多樣性:microbial_年月日編號(hào)
微生物多樣性更新報(bào)告:Microbial_updateReport_年月日編號(hào)
無(wú)宿主宏基因組:MetaG_年月日編號(hào)
有宿主宏基因組:MetaG_宿主拉丁名_年月日編號(hào)
宏基因組更新報(bào)告:metag_updateReport_年月日編號(hào)
微生物基因組:MicroG_年月日編號(hào)數(shù)據(jù)下載:上述報(bào)告查找頁(yè)面 – 點(diǎn)擊左側(cè)數(shù)據(jù) – 進(jìn)入相應(yīng)數(shù)據(jù)文件夾
進(jìn)入 microbial_*(或者其他產(chǎn)品類(lèi)型對(duì)應(yīng)的編號(hào))對(duì)應(yīng)的文件夾下 – 打開(kāi)Needed_Data 文件夾,具體需要下載的文件如下:
打開(kāi)原始數(shù)據(jù)文件夾
目前平臺(tái)不支持文件夾下載,所以需要打開(kāi)相應(yīng)文件夾,全選數(shù)據(jù)后進(jìn)行打包下載。
FTP 下載指導(dǎo):下載方式選擇 FTP 下載,平臺(tái)會(huì)將具體的操作步驟發(fā)到注冊(cè)郵箱賬號(hào)中,也會(huì)發(fā)到個(gè)人中心信息中,如下:
打開(kāi) FTP 客戶端:依次填寫(xiě)好上述主機(jī),用戶名,密碼,端口信息,打開(kāi)之后選擇最新的文件夾,里面就是剛剛選中打包下載的數(shù)據(jù),然后直接選中數(shù)據(jù),拖拽到左邊目標(biāo)文件夾中即可。
建庫(kù)測(cè)序分析產(chǎn)品以結(jié)題報(bào)告的形式交給老師,報(bào)告中的分組以老師提供的分析方案為準(zhǔn)。老師們?cè)谀玫浇Y(jié)果后,可能會(huì)有更改樣本名、重新分組、變更聚類(lèi)參數(shù)、與其他同類(lèi)型項(xiàng)目合并分析等需求。其中,更改樣本名、重新分組、過(guò)濾物種或抽平可以通過(guò)更新結(jié)題報(bào)告實(shí)現(xiàn)(見(jiàn)更新結(jié)題報(bào)告操作指導(dǎo)),而改變質(zhì)控參數(shù)、添加更多樣本則需要重新投遞主流程(見(jiàn) APP 主流程投遞操作指導(dǎo))。
由于原始數(shù)據(jù)為線下交付,不再自動(dòng)備份至云平臺(tái),因此投遞主流程需要老師先將原始數(shù)據(jù)上傳至云平臺(tái)。本指導(dǎo)即為針對(duì)此需求撰寫(xiě)的云平臺(tái)操作指南。
另:主流程分析權(quán)限(標(biāo)準(zhǔn)套餐)每項(xiàng)目一年售后期內(nèi)可以免費(fèi)開(kāi)通 3 次,一次 10天,在權(quán)限時(shí)間內(nèi)沒(méi)有分析次數(shù)限制,但是一次只能投遞一個(gè)任務(wù)。
1、登陸賬號(hào)后,在主頁(yè)面查看項(xiàng)目管理,進(jìn)入“我的數(shù)據(jù)”
2、在我的數(shù)據(jù)中,建議新建文件夾后,進(jìn)入新文件夾,點(diǎn)擊“上傳”,選擇上傳文件或 FTP 上傳。
上傳文件:選 擇 文 件 上 傳 , 點(diǎn) 擊 “ 上 傳 ” , 選 擇 下 載 好 的 原 始 數(shù) 據(jù)(\Needed_Data\Rawdata\01.Rawdata 路徑下的所有文件),點(diǎn)擊確定即可等待數(shù)據(jù)上傳完成。
網(wǎng)頁(yè)只能上傳 200MB 以下的數(shù)據(jù),上傳更大的數(shù)據(jù)請(qǐng)點(diǎn)擊”FTP 上傳”。注:不支持上傳 0 字節(jié)文件!文件名不能包含中文及特殊字符!
FTP 上傳:數(shù)據(jù)量大于 200M 時(shí)使用 FTP 上傳數(shù)據(jù)。選擇“FTP 上傳”后彈出提示對(duì)話框,點(diǎn)擊“確定”后系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)創(chuàng)建一次性的 FTP 賬戶,用于本次數(shù)據(jù)上傳。賬戶信息會(huì)發(fā)送至注冊(cè)郵箱及平臺(tái)的“個(gè)人中心——消息中心”中。依照提示操作即可。
注:數(shù)據(jù)上傳完成后需要通過(guò)中轉(zhuǎn)站中轉(zhuǎn),不會(huì)立刻顯示在平臺(tái)中。具體時(shí)間視數(shù)據(jù)量而定,最久約半天時(shí)間,若仍找不到數(shù)據(jù)請(qǐng)聯(lián)系售后人員處理。
1、私有云平臺(tái)主頁(yè)
2、分析平臺(tái)參數(shù)頁(yè)面
3、在線查看分析報(bào)告
4、個(gè)性化分析功能展示
為滿足中小課題組的生信分析需求,百邁客推出輕量版私有云:將生信分析平臺(tái)部署在一臺(tái)高性能工作站上,實(shí)現(xiàn)開(kāi)箱即用,作為百邁客私有云的有力補(bǔ)充。
為解決大家在Linux操作系統(tǒng)中,安裝和使用生信軟件時(shí)遇到的種種問(wèn)題,百邁客全面升級(jí)了專(zhuān)用機(jī)搭載的軟件功能,我們的優(yōu)勢(shì):
1)硬件:根據(jù)用戶的計(jì)算需求,我們可以提供從工作站到機(jī)架式服務(wù)器的各種硬件配置,且可以根據(jù)您的計(jì)算類(lèi)型,合理配置CPU數(shù)目和內(nèi)存大小,實(shí)現(xiàn)硬件資源的組合。
2)軟件:根據(jù)用戶需求我們提供了常用生信軟件,并封裝和串聯(lián)成常用分析模塊,通過(guò)單行命令即可完成很多常規(guī)分析內(nèi)容,如基因表達(dá)量計(jì)算、突變檢測(cè)、基因功能注釋等。
部分可部署生信模塊如下:
三大產(chǎn)品形態(tài),覆蓋生信數(shù)據(jù)分析場(chǎng)景,
總有一款適合您!