先睹為快：新一代植物廣靶定量代謝技術(shù)

本次發(fā)布的植物廣靶定量代謝組學(xué)產(chǎn)品并非簡(jiǎn)單技術(shù)迭代，百譜生物研發(fā)經(jīng)理李天運(yùn)在發(fā)布會(huì)中詳細(xì)介紹了該產(chǎn)品是針對(duì)植物研究領(lǐng)域長(zhǎng)期存在的檢測(cè)靈敏度不足、數(shù)據(jù)庫(kù)不全、缺少內(nèi)標(biāo)定量三大痛點(diǎn)，形成多維度解決方案，獲與會(huì)專家高度認(rèn)可。

高靈敏檢測(cè)：突破微量代謝物局限

針對(duì)傳統(tǒng)技術(shù)難以捕捉植物抗逆、品質(zhì)形成過(guò)程中微量代謝物的痛點(diǎn)，該產(chǎn)品采用 AB SCIEX QTRAP7500 高靈敏度檢測(cè)平臺(tái)，將檢測(cè)限降低一個(gè)數(shù)量級(jí)，可精準(zhǔn)定量低豐度植物代謝物、特殊滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)等低含量成分。即使是植物應(yīng)對(duì)脅迫時(shí)微量積累的關(guān)鍵代謝物，也能被清晰捕捉。

數(shù)據(jù)庫(kù)完整性：高達(dá)7萬(wàn)種代謝物

代謝組研究的核心在于數(shù)據(jù)庫(kù)完整性，該產(chǎn)品將代謝物數(shù)據(jù)庫(kù)從傳統(tǒng) “數(shù)千種” 擴(kuò)容至 “數(shù)萬(wàn)種”，高達(dá)7萬(wàn)種，并補(bǔ)充標(biāo)準(zhǔn)品多維注釋信息，使代謝物鑒定準(zhǔn)確率大幅提升，可有效避免 “漏檢關(guān)鍵成分”“誤判物質(zhì)種類” 等問(wèn)題。

業(yè)內(nèi)首發(fā)：同位素內(nèi)標(biāo)定量

業(yè)內(nèi)首次在植物廣靶技術(shù)上加入同位素內(nèi)標(biāo)進(jìn)行定量分析平臺(tái)，擁有多種內(nèi)標(biāo)選擇，能根據(jù)不同的檢測(cè)需求和化合物特性，靈活挑選合適的內(nèi)標(biāo)，通過(guò)基質(zhì)內(nèi)標(biāo)線性和自研算法校正，可以得到更為準(zhǔn)確的定量結(jié)果。

SCIEX中國(guó)市場(chǎng)開(kāi)發(fā)經(jīng)理方晶晶深度解讀了QTRAP7500設(shè)備技術(shù)的革新和優(yōu)勢(shì)，他認(rèn)為：“代謝物的高通量、高靈敏和大隊(duì)列穩(wěn)定性是未來(lái)代謝組發(fā)展的重要方向”。

企業(yè)戰(zhàn)略布局：推動(dòng)代謝組技術(shù)從實(shí)驗(yàn)室走向田間

發(fā)布會(huì)上，百邁客生物創(chuàng)始人兼CEO鄭洪坤指出行業(yè)核心痛點(diǎn)：“測(cè)序能找植物的基因，但代謝組才懂它的‘品質(zhì)’！”他表示，現(xiàn)在代謝組在農(nóng)業(yè)里的用處還沒(méi)完全打開(kāi)，未來(lái)要靠 “測(cè)序 + 代謝組” 組合拳，比如在育種環(huán)節(jié)通過(guò)基因篩選鎖定潛力品種，再以代謝組驗(yàn)證維生素含量等品質(zhì)指標(biāo)，提升育種效率與準(zhǔn)確性。

百譜生物總經(jīng)理曹以襯公布近期發(fā)展規(guī)劃：這款植物廣靶定量代謝組學(xué)產(chǎn)品，是我們團(tuán)隊(duì)潛心研發(fā)的核心成果——它打破了傳統(tǒng)技術(shù)在檢測(cè)靈敏度、數(shù)據(jù)庫(kù)覆蓋度上的局限，將成為植物研究領(lǐng)域的高效工具！未來(lái)我們將聯(lián)合頂尖設(shè)備廠商升級(jí)檢測(cè)平臺(tái)，進(jìn)一步提升超微量代謝物檢測(cè)能力，為農(nóng)業(yè)科研創(chuàng)新、品種改良與產(chǎn)業(yè)升級(jí)提供關(guān)鍵支撐。

專家實(shí)踐驗(yàn)證：技術(shù)落地解決產(chǎn)業(yè)實(shí)際難題

北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院王旭教授（左二）、中國(guó)科學(xué)院海洋研究所段德麟研究員（右二）、中國(guó)科學(xué)院海洋研究所張立濤副研究員（右一）

新聞相關(guān)報(bào)道

?9?月?17?日，百邁客生物推出的植物廣靶定量代謝技術(shù)，標(biāo)志著植物代謝組學(xué)正式進(jìn)入廣靶、精準(zhǔn)、實(shí)用的新階段，未來(lái)將在功能食品開(kāi)發(fā)、作物育種優(yōu)化、農(nóng)業(yè)抗逆管理等多個(gè)方面發(fā)揮深遠(yuǎn)影響。>>詳情

2025?年?9?月?17?日，由百邁客生物與百譜生物聯(lián)合主辦的?“植物廣靶定量代謝組學(xué)發(fā)布會(huì)”?在青島成功舉辦。會(huì)上推出的植物廣靶定量代謝組學(xué)技術(shù)，為植物基礎(chǔ)研究與農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)升級(jí)注入新動(dòng)能，引發(fā)行業(yè)廣泛關(guān)注。中國(guó)科學(xué)院海洋研究所段德麟研究員、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院王旭教授等專家出席。>>詳情

2025 年 9 月 17 日，在青島舉辦的“植物廣靶定量代謝組學(xué)發(fā)布會(huì)”上。百邁客生物與百譜生物聯(lián)合推出植物廣靶定量代謝組學(xué)技術(shù)，為植物基礎(chǔ)研究與農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)升級(jí)注入新動(dòng)能，引發(fā)行業(yè)廣泛關(guān)注。中國(guó)科學(xué)院海洋研究所段德麟研究員、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院王旭教授等專家與企業(yè)代表應(yīng)邀出席。>>詳情

9月17日，新一代植物廣靶定量代謝組學(xué)技術(shù)在青島自貿(mào)片區(qū)發(fā)布，該技術(shù)使得植物在抗逆、品質(zhì)形成過(guò)程中微量積累的關(guān)鍵代謝物得以清晰捕捉，為深入研究植物生理機(jī)制注入新的科研動(dòng)力。中國(guó)科學(xué)院海洋研究所段德麟研究員等行業(yè)專家受邀出席。>>詳情

9月17日，百邁客生物在青島自貿(mào)片區(qū)發(fā)布新一代植物廣靶定量代謝組學(xué)技術(shù)，該技術(shù)直面植物研究領(lǐng)域長(zhǎng)期存在的三大核心難題：檢測(cè)靈敏度低、代謝物覆蓋范圍有限、缺乏精準(zhǔn)定量的內(nèi)標(biāo)方法，通過(guò)多維創(chuàng)新提升植物代謝組學(xué)研究的效率與準(zhǔn)確性。>>詳情

2025年9月17日，百邁客生物與百譜生物聯(lián)合發(fā)布“植物廣靶定量代謝組學(xué)技術(shù)” 。該技術(shù)采用?AB SCIEX QTRAP7500?高靈敏度檢測(cè)平臺(tái)，將檢測(cè)限降低一個(gè)數(shù)量級(jí)，相較于傳統(tǒng)?SCIEX Triple Quad? 6500 +?平臺(tái)，對(duì)低豐度植物代謝物、特殊滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)等低含量成分的檢測(cè)能力顯著提升。為深入研究植物生理機(jī)制提供更多可能。>>詳情

9月17日，百邁客生物與百譜生物聯(lián)合發(fā)布“植物廣靶定量代謝組學(xué)技術(shù)” 。這一技術(shù)使得植物在抗逆、品質(zhì)形成過(guò)程中微量積累的關(guān)鍵代謝物得以清晰捕捉，為深入研究植物生理機(jī)制提供了技術(shù)可能。中國(guó)科學(xué)院海洋研究所段德麟研究員、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院王旭教授等行業(yè)專家及企業(yè)代表受邀出席。>>詳情

植物研究領(lǐng)域受限于檢測(cè)靈敏度不足、代謝物數(shù)據(jù)庫(kù)不全、缺乏精準(zhǔn)內(nèi)標(biāo)定量等問(wèn)題，尤其是在非模式植物研究中，微量代謝物難以捕捉、關(guān)鍵成分易漏檢誤判、定量結(jié)果準(zhǔn)確性不足等痛點(diǎn)，嚴(yán)重制約了研究效率與產(chǎn)業(yè)應(yīng)用進(jìn)程。此次發(fā)布的植物廣靶定量代謝組學(xué)技術(shù)，針對(duì)性提出多維度解決方案。>>詳情

]]> http://www.tombstonesilverworks.com/archives/34741 Fri, 05 Sep 2025 10:01:25 +0000 http://www.tombstonesilverworks.com/?p=34741 2025年9月4日，北京市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)、中關(guān)村科技園區(qū)管理委員會(huì)下屬北京科技創(chuàng)新促進(jìn)中心、北京醫(yī)藥健康科技發(fā)展中心等單位相關(guān)領(lǐng)導(dǎo)一行，蒞臨百邁客生物開(kāi)展調(diào)研指導(dǎo)工作。雙方圍繞企業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀、科技創(chuàng)新突破、政策精準(zhǔn)對(duì)接等核心議題，展開(kāi)深入交流與探討，為企業(yè)高質(zhì)量發(fā)展注入政策動(dòng)能。

本次調(diào)研由北京科技創(chuàng)新促進(jìn)中心黨委書(shū)記李萍帶隊(duì)，科技服務(wù)業(yè)部部長(zhǎng)付文均、城市科技部部長(zhǎng)曲宏，以及北京醫(yī)藥健康科技發(fā)展中心前沿部部長(zhǎng)李潛等領(lǐng)導(dǎo)共同參與；百邁客生物聯(lián)合創(chuàng)始人王瑞、財(cái)務(wù)負(fù)責(zé)人蔣躍征等陪同接待，并與調(diào)研團(tuán)隊(duì)進(jìn)行座談交流。

座談會(huì)上，王瑞首先對(duì)市科委領(lǐng)導(dǎo)一行的到來(lái)表示熱烈歡迎，并圍繞百邁客生物的發(fā)展歷程、核心業(yè)務(wù)板塊、核心技術(shù)優(yōu)勢(shì)，以及未來(lái)在基因科技領(lǐng)域的長(zhǎng)期戰(zhàn)略布局作詳細(xì)介紹。她強(qiáng)調(diào)，百邁客生物始終以?“技術(shù)創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)產(chǎn)業(yè)發(fā)展”?為核心理念，深耕生命科學(xué)領(lǐng)域，致力于為生命科學(xué)領(lǐng)域提供高質(zhì)量的產(chǎn)品與服務(wù)。

隨后，市科委各位領(lǐng)導(dǎo)結(jié)合各自分管領(lǐng)域，針對(duì)百邁客生物的發(fā)展痛點(diǎn)與未來(lái)方向，提出了兼具專業(yè)性與指導(dǎo)性的建議：

此次調(diào)研不僅深化了市科委對(duì)百邁客生物發(fā)展現(xiàn)狀與核心需求的精準(zhǔn)了解，更為企業(yè)后續(xù)在政策對(duì)接、資源整合、戰(zhàn)略規(guī)劃等方面提供了明確的方向和支持等方面提供了明確的方向指引與支持。百邁客生物將以此為契機(jī)，進(jìn)一步加強(qiáng)與政府部門(mén)的常態(tài)化溝通協(xié)作，加速科技創(chuàng)新與成果轉(zhuǎn)化，為推動(dòng)北京國(guó)際科技創(chuàng)新中心建設(shè)、助力基因科技行業(yè)高質(zhì)量發(fā)展積極貢獻(xiàn)企業(yè)力量。

BH1000時(shí)空成像系統(tǒng)

成像在空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)中的重要作用

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，其核心在于將測(cè)序數(shù)據(jù)與精確的成像相結(jié)合。然而，實(shí)踐中我們有時(shí)會(huì)不自覺(jué)地將焦點(diǎn)過(guò)度集中在測(cè)序數(shù)據(jù)上，而忽略了同樣關(guān)鍵的成像環(huán)節(jié)。在空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)的全過(guò)程中，其中有三個(gè)關(guān)鍵步驟需要成像：

結(jié)構(gòu)確認(rèn)

在樣本完成質(zhì)檢并合格后，需要對(duì)研究的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行確認(rèn)，可以利用BH1000進(jìn)行高清（標(biāo)配高品質(zhì)平場(chǎng)復(fù)消色差物鏡，20×物鏡，數(shù)值孔徑N.A.≥0.8,?同時(shí)最多支持拓展4個(gè)物鏡）的明場(chǎng)成像來(lái)進(jìn)行判斷。

組織優(yōu)化

通過(guò)BH1000快速（20X，8mm*8mm,小于50S）得到高清明場(chǎng)圖像與高清的熒光（支持7個(gè)熒光通道,各通道有獨(dú)立傳感器，電動(dòng)切換，標(biāo)配明場(chǎng)、?DAPI、FITC和CY3）成像結(jié)果來(lái)選擇最優(yōu)的透化時(shí)間（需要選擇熒光最亮且符合相應(yīng)明場(chǎng)結(jié)構(gòu)無(wú)明顯逸散的梯度）

基因表達(dá)

可以利用BH1000對(duì)明場(chǎng)及熒光掃描過(guò)程中經(jīng)常出現(xiàn)的拼接錯(cuò)誤進(jìn)行校準(zhǔn)（自主研發(fā)BMCHiper軟件，搭配自研半透半返模塊，實(shí)現(xiàn)圖像無(wú)錯(cuò)校準(zhǔn)），得到原片無(wú)錯(cuò)高清的熒光圖像與原片無(wú)錯(cuò)高清的明場(chǎng)圖像，為后續(xù)空間數(shù)據(jù)準(zhǔn)確的定位和可視化提供基礎(chǔ)，使得復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)能夠轉(zhuǎn)化為最直觀，最精準(zhǔn)的生物學(xué)見(jiàn)解。

BMKMANU BH1000產(chǎn)品

BMKMANU BH1000是專門(mén)適配精準(zhǔn)空間組學(xué)BMKMANU S系列產(chǎn)品的成像系統(tǒng)，它不僅可以實(shí)現(xiàn)各類物種及各類玻片標(biāo)本的快速全切片掃描成像，還能能夠滿足百創(chuàng)空間組學(xué)中各個(gè)實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié)的成像需求，更能搭配使用百創(chuàng)細(xì)胞分割算法，結(jié)合其輸出的原片無(wú)錯(cuò)高清明場(chǎng)成像，原片無(wú)錯(cuò)高清熒光成像實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)空間單細(xì)胞分割。

產(chǎn)品參數(shù)

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

用戶友好型界面，可實(shí)現(xiàn)一鍵式操作，自動(dòng)對(duì)焦、自動(dòng)掃描，圖像質(zhì)量?jī)?yōu)異

50S內(nèi)可完成8mm*8mm 20X掃描，支持掃描25mm*60mm,原片明場(chǎng)及原片熒光成像

多層掃描：支持多景深模式和融合模式

支持多區(qū)域掃描

精準(zhǔn)細(xì)胞分割：內(nèi)嵌圖像校準(zhǔn)模式，可以實(shí)現(xiàn)對(duì)圖像進(jìn)行校準(zhǔn)拼接，直接輸出原片無(wú)錯(cuò)圖像

七通道多色熒光

拓展應(yīng)用范圍

這是最早關(guān)于人類免疫學(xué)應(yīng)用的記錄。公元前?400?年，中國(guó)可能已有人痘苗接種預(yù)防天花的方法，到?16?世紀(jì)明朝隆慶年間，人痘接種法得到重大改進(jìn)并廣泛應(yīng)用，17?世紀(jì)傳入俄國(guó)、朝鮮、日本、土耳其和英國(guó)等國(guó)家，至18世紀(jì)末結(jié)束經(jīng)驗(yàn)免疫學(xué)時(shí)期，隨后免疫學(xué)又經(jīng)歷了經(jīng)典免疫學(xué)時(shí)期，近代免疫學(xué)時(shí)期，直到1965年/1968年?B細(xì)胞/T細(xì)胞的發(fā)現(xiàn)開(kāi)啟了現(xiàn)代免疫學(xué)時(shí)期。

隨著免疫學(xué)的逐步發(fā)展，免疫組學(xué)技術(shù)也隨之進(jìn)入了迅速發(fā)展的時(shí)期，先后發(fā)展出了標(biāo)記免疫組技術(shù)、免疫組化技術(shù)、Bulk?T/BCR測(cè)序技術(shù)以及近幾年興起的單細(xì)胞T/BCR測(cè)序技術(shù)，并帶動(dòng)了相關(guān)科學(xué)的進(jìn)步。

2017年，張澤民院士研究組，通過(guò)大規(guī)模單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)對(duì)肝癌相關(guān)T淋巴細(xì)胞進(jìn)行分析，首次在單細(xì)胞水平上描繪肝癌微環(huán)境中免疫細(xì)胞圖譜，發(fā)現(xiàn)了肝癌免疫療法的潛在靶點(diǎn)，也為我們從多角度系統(tǒng)性理解肝癌T淋巴細(xì)胞特征奠定了基礎(chǔ)。（2017，Cell，Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing）

2024年，復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士和高強(qiáng)教授、中國(guó)科學(xué)院上海免疫與感染研究所張曉明研究員、浙江大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院郭國(guó)驥教授合作在Science上發(fā)表了題為A blueprint for tumor-infiltrating B cells across human cancers的研究論文，結(jié)合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、 B細(xì)胞受體免疫組庫(kù)和表觀基因組的多組學(xué)數(shù)據(jù)，系統(tǒng)性地刻畫(huà)了腫瘤浸潤(rùn)性B細(xì)胞的異質(zhì)性、動(dòng)態(tài)分化和表觀調(diào)控機(jī)制。創(chuàng)新地揭示了腫瘤微環(huán)境中廣泛存在的EF應(yīng)答的癌種偏好性、空間定位特征、臨床意義及潛在的誘導(dǎo)調(diào)控機(jī)制。

但是，與逐漸成熟的單細(xì)胞T/BCR測(cè)序不同，空間T/BCR測(cè)序測(cè)序技術(shù)還一直未能有較好的測(cè)序技術(shù)產(chǎn)品去做支撐，成果尚少，現(xiàn)有的文章技術(shù)還局限于使用早期的低分辨率轉(zhuǎn)錄芯片為依托。成熟穩(wěn)定且高分辨率的空間T/BCR測(cè)序技術(shù)產(chǎn)品的缺乏限制了空間免疫組的研究。

百創(chuàng)空間全長(zhǎng)免疫組庫(kù)測(cè)序技術(shù)?BMKMANU?S3000-VDJ

2024年12月，百邁客生物智能制造以廣受市場(chǎng)好評(píng)的亞細(xì)胞級(jí)S系列空間轉(zhuǎn)錄組芯片為依托，開(kāi)發(fā)出了在原片上可同時(shí)捕獲3’端轉(zhuǎn)錄組信息以及全長(zhǎng)B細(xì)胞受體（BCR）和T細(xì)胞受體（TCR）序列的空間T/BCR測(cè)序技術(shù)產(chǎn)品—BMKMANU?S3000-VDJ?，將填補(bǔ)這一技術(shù)產(chǎn)品的缺口。

實(shí)測(cè)案例-某腫瘤-百創(chuàng)單細(xì)胞級(jí)空間免疫組結(jié)果

BMKMANU?S3000-VDJ?技術(shù)，使用新鮮OCT包埋樣本，在分辨率為3.5μm的芯片上同一張組織切片（10μm）實(shí)現(xiàn)3’端mRNA，以及全長(zhǎng)TCR/BCR的捕獲。利用百邁客生物智能制造獨(dú)有的圖像校準(zhǔn)及細(xì)胞分割技術(shù)，得到單細(xì)胞級(jí)分辨率的空間轉(zhuǎn)錄組結(jié)果及單細(xì)胞級(jí)分辨率的空間T/BCR數(shù)據(jù)。

BMKMANU?S3000-VDJ??技術(shù)路線

精準(zhǔn)空間細(xì)胞注釋

得到的單細(xì)胞級(jí)空間轉(zhuǎn)錄組結(jié)果，可以進(jìn)行常規(guī)的空間轉(zhuǎn)錄組分析，并進(jìn)行精準(zhǔn)的細(xì)胞注釋。

精準(zhǔn)細(xì)胞注釋及T/B細(xì)胞的空間分布

T/B細(xì)胞的亞群定位

對(duì)于得到的T細(xì)胞及B細(xì)胞又可以繼續(xù)進(jìn)行詳細(xì)的亞群分類，同時(shí)探討亞群之前的相互轉(zhuǎn)換關(guān)系以及與表型之前的關(guān)系。

T/B Cells 亞群分類，亞群空間分布及亞群發(fā)育軌跡分析

TCR/BCR?空間分布以及豐度分析

TCR和BCR的豐度分析可以揭示免疫反應(yīng)的多樣性和動(dòng)態(tài)變化。例如，TCR的多樣性在腫瘤進(jìn)展過(guò)程中會(huì)發(fā)生變化，早期肝癌患者的TCR和BCR均勻性更高，而晚期患者則表現(xiàn)出較低的均勻性。此外，TCR和BCR的豐度變化也可以反映免疫細(xì)胞的激活狀態(tài)和克隆擴(kuò)增情況。

克隆型空間分布以及豐度分析

腫瘤樣本我們可以類比為一處具有復(fù)雜地貌的特殊地理環(huán)境，不同的環(huán)境造就了各種細(xì)胞的不同狀態(tài)，而T/B細(xì)胞在不同的“選擇壓力”下邊進(jìn)行了不同的“適應(yīng)性進(jìn)化”。對(duì)不同生態(tài)位的T/B細(xì)胞尤其是TCR/BCR進(jìn)行測(cè)定，有助于我們?nèi)ソ沂久庖呒?xì)胞的克隆起源和進(jìn)化過(guò)程。例如，通過(guò)分析TCR的VDJ重排，可以追蹤T細(xì)胞克隆的起源和擴(kuò)增過(guò)程。這種分析有助于理解免疫細(xì)胞在不同生理和病理狀態(tài)下的動(dòng)態(tài)變化。

百創(chuàng)單細(xì)胞級(jí)空間全長(zhǎng)免疫組產(chǎn)品?BMKMANU?S3000-VDJ，將幫助科研者解決整個(gè)轉(zhuǎn)錄組和組織形態(tài)學(xué)問(wèn)題，實(shí)現(xiàn)人類腫瘤或其它病變組織中B細(xì)胞和T細(xì)胞克隆的高保真定位和空間譜系追蹤，將在一定程度上促進(jìn)對(duì)各種臨床相關(guān)現(xiàn)象（如感染、疫苗接種和癌癥）中淋巴細(xì)胞空間動(dòng)力學(xué)的理解。

劉恒康博士研究方向?yàn)槔每臻g多組學(xué)探究腫瘤細(xì)胞遺傳變異及其與微環(huán)境的相互作用在腫瘤演化過(guò)程中的規(guī)律和機(jī)制。在本次講座中劉博士分享了一篇發(fā)表于Cancer Cell的封面文章，其中百邁客生物為該研究提供了百創(chuàng)S1000空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)。

與以往研究不同的是，這篇文章在研究中同時(shí)納入原發(fā)灶以及侵襲性黑色素瘤，結(jié)合多組學(xué)技術(shù)手段，挖掘腫瘤侵襲的克隆演化規(guī)律的同時(shí)，發(fā)現(xiàn)了AM（原位肢端黑色素瘤）的C3分子亞型預(yù)后更差，這與C3亞型微環(huán)境中浸潤(rùn)更多免疫細(xì)胞以及免疫抑制微環(huán)境相關(guān)。其中APOE+/CD163+巨噬細(xì)胞通過(guò)IGF1-IGF1R促進(jìn)了腫瘤細(xì)胞EMT轉(zhuǎn)化，這一發(fā)現(xiàn)也在體外細(xì)胞共培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)、額外的患者隊(duì)列中得到了驗(yàn)證，為臨床評(píng)估黑色素瘤患者預(yù)后提供了新的視角，即肢端型黑色素瘤組織中APOE+CD163+雙陽(yáng)與患者更差預(yù)后相關(guān)。

首期 “一作面對(duì)面” 腫瘤專題講座圓滿收官，前沿干貨精彩紛呈！

百邁客生物 “一作面對(duì)面” 腫瘤專題系列講座將持續(xù)推出肺癌、肝癌、結(jié)直腸癌、胃癌、乳腺癌、宮頸癌、前列腺癌等多癌種專場(chǎng)，致力于打造腫瘤醫(yī)學(xué)領(lǐng)域前沿研究的高端分享平臺(tái) —— 聚焦研究思路與成果的深度交流，探索臨床問(wèn)題向科學(xué)研究的轉(zhuǎn)化路徑，解析前沿技術(shù)驅(qū)動(dòng)的認(rèn)知革新，并揭示科研成果的臨床價(jià)值落地邏輯。

誠(chéng)邀腫瘤研究領(lǐng)域?qū)＜覍W(xué)者共聚云端

愿思維碰撞出的火花

最終變?yōu)榱一鸱賰舨⊥丛旄V大患者

7月9日19:30

我們下期再會(huì)！

中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李霖鋒教授以“雜草稻的起源與適應(yīng)性進(jìn)化”為題，依托《Nature Communications》發(fā)表的題為”Porous borders at the wild-crop interface promote weed adaptation in Southeast Asia”?的文章，以文章中雜草稻基因組組裝及群體進(jìn)化為基礎(chǔ)，延伸介紹了從雜草稻的表性調(diào)研及分類，馴化過(guò)程中的品系選育，馴化關(guān)鍵基因選擇以及雜草稻適應(yīng)性進(jìn)化研究對(duì)栽培水稻育種的重要作用等，整場(chǎng)演講深入淺出，引起了各位老師的熱烈討論。

北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院陳為凱副研究員陳老師則以“本氏煙草完整基因組揭示其著絲粒復(fù)雜結(jié)構(gòu)及進(jìn)化歷史”為題，詳細(xì)介紹了老師在《Nature Plants》發(fā)表的題為?“The complete genome assembly of Nicotiana benthamiana reveals the genetic and epigenetic landscape of centromeres”?的研究課題，演講內(nèi)容從煙草的T2T基因組組裝開(kāi)始，深入分析了不同物種著絲粒標(biāo)志序列特征并對(duì)其進(jìn)行分類，整合Chip-seq及甲基化數(shù)據(jù)共同構(gòu)建了本氏煙草著絲粒形成和進(jìn)化的模型，該模型涉及新著絲粒的形成及反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子等方面信息，整場(chǎng)演講內(nèi)容詳盡思路完整，也引發(fā)了各位在場(chǎng)老師的思考。

百邁客生物高級(jí)產(chǎn)品經(jīng)理聶寧寧圍繞兩位學(xué)者研究中涉及的基因組學(xué)與群體進(jìn)化研究相關(guān)組學(xué)工具展開(kāi)深度解析。

這場(chǎng)學(xué)術(shù)盛宴雖已落幕，但其引發(fā)的思考與探索仍在持續(xù)。7月16日14:00，我們將迎來(lái)第二期直播。屆時(shí)，將有新的行業(yè)權(quán)威專家匯聚一堂，圍繞作物育種領(lǐng)域的新興技術(shù)、前沿理論等展開(kāi)深入探討，為大家?guī)?lái)更多關(guān)于作物育種的創(chuàng)新思路與解決方案。

請(qǐng)持續(xù)關(guān)注百邁客生物官方消息，讓我們共同期待7月16日再次相聚云端，共探作物育種新前沿！

為了推動(dòng)動(dòng)物腸道微生物的深入研究，2025年6月24日，百邁客生物特邀三位深耕該領(lǐng)域的權(quán)威專家，以動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)為核心，開(kāi)展此次主題學(xué)術(shù)沙龍，圍繞動(dòng)物腸道微生態(tài)調(diào)控、菌群功能解析、宿主互作機(jī)制等熱點(diǎn)議題，帶來(lái)高水準(zhǔn)學(xué)術(shù)報(bào)告。這不僅是一場(chǎng)知識(shí)與思想的盛宴，更是探索動(dòng)物健康養(yǎng)殖、疾病防控新路徑的交流平臺(tái)，讓我們共同探討動(dòng)物腸道微生物世界的無(wú)限可能，攜手推動(dòng)學(xué)科發(fā)展與技術(shù)革新！

會(huì)議聚焦：微觀世界大能量

一、反芻動(dòng)物消化道微生物組互作與功能研究

本次沙龍中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院草原研究所劉孝珍老師探討了反芻動(dòng)物消化道微生物組研究的重要性，并從不同方向展開(kāi)：

• 微生物組研究:通過(guò)宏基因組組裝基因組技術(shù)，解析微生物組結(jié)構(gòu)組成、與宿主和環(huán)境的關(guān)系以及其功能；
• 互作機(jī)制研究:?探究微生物之間的相互作用機(jī)制，例如群體感應(yīng)以及這些機(jī)制如何影響微生物群落結(jié)構(gòu)和功能；
• 暗物質(zhì)開(kāi)發(fā)與利用:?挖掘未被充分認(rèn)知的微生物暗物質(zhì)，包括未被培養(yǎng)的微生物類群、非編碼小RNA和未知代謝產(chǎn)物，并開(kāi)發(fā)其潛在應(yīng)用價(jià)值。

二、畜禽微生物研究的變與不變

本次沙龍西北農(nóng)林科技大學(xué)武老師對(duì)國(guó)內(nèi)外關(guān)于畜禽微生物組研究工作進(jìn)行了整體梳理，從以下七個(gè)部分展開(kāi)：

• 胃腸道微生物組目錄構(gòu)建及功能挖掘：利用宏基因組及binning分析進(jìn)行胃腸道宏基因組目錄構(gòu)建及功能挖掘，并介紹了其他胃腸道微生物組研究方法；
• 胃腸道微生物互作研究：介紹微生物間互作關(guān)系，及互作關(guān)系的研究方法；
• 胃腸道微生物-宿主互作：介紹近幾年研究比較多的由胃腸道微生物所產(chǎn)生的代謝物，這些代謝物是如何調(diào)控宿主的一系列功能；
• 宿主-胃腸道微生物互作：該部分內(nèi)容闡明了宿主是如何影響微生物，并介紹了一系列近幾年熱門(mén)的研究方法；
• 消化道穩(wěn)態(tài)營(yíng)養(yǎng)與微生物功能調(diào)控：基于消化道健康的五環(huán)標(biāo)準(zhǔn)，開(kāi)展消化道營(yíng)養(yǎng)研究，例如圍繞生產(chǎn)效率低下、階段性代謝性疾病多和飼料飼草資源短缺等方向開(kāi)展飼料養(yǎng)分高效利用的研究；
• 科赫法則-從微生物到微生物組：介紹了微生物時(shí)代的”科赫法則”，如何去實(shí)現(xiàn)由因果關(guān)系到因果機(jī)制的驗(yàn)證，未來(lái)又該從哪些角度去展開(kāi)；
• 高顏值在線數(shù)據(jù)分析、繪圖與論文組圖

三、“腸-生殖”軸建立的作用機(jī)制探究

本次沙龍內(nèi)蒙古大學(xué)周揚(yáng)老師介紹了她近幾年的研究成果，基于“腸-生殖”軸建立的相關(guān)作用機(jī)制，進(jìn)一步去開(kāi)發(fā)羊營(yíng)養(yǎng)代謝性疾病的繁殖調(diào)控技術(shù)，研發(fā)提高羊精液品質(zhì)的飼料添加劑。

• 腸-睪軸：構(gòu)建羊代謝紊亂模型，紊亂模型中精子發(fā)生異常、質(zhì)量下降，研究發(fā)現(xiàn)菌群失調(diào)影響膽汁酸水平進(jìn)而影響維生素A吸收，維生素A吸收受阻影響精子發(fā)生，闡明了代謝性紊亂誘發(fā)的反芻動(dòng)物羊繁殖力下降的腸-睪軸新機(jī)制；
• 腸-睪軸：MLT通過(guò)改善腸道菌群的微生態(tài)系統(tǒng)，挽救了代謝素亂疾病引發(fā)的精子發(fā)生異常和睪丸細(xì)胞凋亡，為反芻動(dòng)物羊由代謝素亂引發(fā)的繁殖疾病診斷和防治提供了新的思路；
• 基于腸-生殖軸進(jìn)行后續(xù)研究：通過(guò)補(bǔ)充維生素B1來(lái)預(yù)防母體代謝紊亂對(duì)雌性后代繁殖性能的影響，這項(xiàng)研究為保護(hù)后代繁殖力提供了新的診療思路；
• 羊精準(zhǔn)繁養(yǎng)育一體化：精準(zhǔn)繁養(yǎng)助力良種培育:建立何時(shí)喂，喂多少，喂什么的標(biāo)準(zhǔn)。針對(duì)羊高產(chǎn)經(jīng)濟(jì)性狀(主要圍繞產(chǎn)肉、產(chǎn)奶)，依托已建立益生元庫(kù)，研發(fā)提升羊肉和羊奶品質(zhì)的新技術(shù)和新產(chǎn)品。

通過(guò)今天的沙龍，我們對(duì)腸道菌群之間的協(xié)同互作，菌群對(duì)代謝的影響機(jī)制等科學(xué)問(wèn)題有了更全面的認(rèn)識(shí)，也對(duì)腸道菌群與宿主的互惠共生關(guān)系有了更深層次的理解。本次沙龍圓滿閉幕，我們將持續(xù)打造第五期微生物領(lǐng)域系列學(xué)術(shù)盛宴，屆時(shí)期待與您在科研長(zhǎng)河中激蕩思想，共濺新浪花！

發(fā)布會(huì)上，百創(chuàng)智造副總裁劉敏詳細(xì)介紹了百創(chuàng)空間ATAC-Seq技術(shù)原理，產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)，應(yīng)用場(chǎng)景及實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)，通過(guò)百創(chuàng)獨(dú)有的S系列空間芯片作為底層拓展開(kāi)發(fā)，實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞級(jí)空間ATAC-seq，并表示DEMO數(shù)據(jù)預(yù)計(jì)1-2周發(fā)布。上海達(dá)澈生物高級(jí)產(chǎn)品經(jīng)理王雨琦分享了使用百創(chuàng)空間ATAC-seq得到的實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)。

百創(chuàng)空間ATAC-seq技術(shù)原理

百創(chuàng)空間ATAC-seq產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

01??提供ATAC的空間位置信息

傳統(tǒng)的 ATAC-Seq 技術(shù)雖然能夠揭示染色質(zhì)的開(kāi)放性，但無(wú)法提供細(xì)胞在組織中的空間位置信息。百創(chuàng)空間 ATAC-Seq 技術(shù)，能夠在組織切片上直接進(jìn)行染色質(zhì)可及性分析，保留細(xì)胞的空間信息。

02?解碼基因表達(dá)的空間調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

百創(chuàng)空間 ATAC-Seq 技術(shù)能夠同時(shí)分析基因表達(dá)和基因調(diào)控機(jī)制，為空間生物學(xué)研究增加了新的維度。它可以幫助研究人員在空間維度繪制染色質(zhì)可及性圖譜，揭示基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制。

03 多組學(xué)整合：從碎片到全景

空間ATAC-Seq與空間轉(zhuǎn)錄組、空間免疫組、原位熒光等技術(shù)聯(lián)用，實(shí)現(xiàn)“表觀遺傳-轉(zhuǎn)錄組-驗(yàn)證”的多維數(shù)據(jù)整合。這種一體化策略，可幫助科學(xué)家在發(fā)育研究中構(gòu)建更完整的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，甚至發(fā)現(xiàn)此前未知的關(guān)鍵通路。

百創(chuàng)空間ATAC-seq與百創(chuàng)S3000空間轉(zhuǎn)錄組對(duì)齊

百創(chuàng)空間ATAC-seq產(chǎn)品實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)

小鼠胚胎

小鼠腦

肝臟腫瘤

百創(chuàng)智造自主研發(fā)的”空間ATAC-Seq全流程解決方案”，成功填補(bǔ)空間表觀遺傳學(xué)研究領(lǐng)域的商業(yè)化產(chǎn)品空白。該產(chǎn)品通過(guò)整合多維組學(xué)分析框架，突破性實(shí)現(xiàn)了染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域的三維空間解析，為科研工作者構(gòu)建”時(shí)空分辨-基因調(diào)控”研究體系提供關(guān)鍵工具。其創(chuàng)新性技術(shù)方案將深度賦能發(fā)育分化機(jī)制解析、腫瘤免疫微環(huán)境解碼、神經(jīng)退行性疾病研究等重大科學(xué)命題。

未來(lái)，百創(chuàng)智造將持續(xù)以技術(shù)創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)行業(yè)發(fā)展，與全球科研伙伴攜手，共同解鎖生命科學(xué)的更多未知奧秘，讓空間生物學(xué)研究從 “單一視角” 邁向 “全景解析” 的新時(shí)代！

在測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展中，DNBseq及SURFseq?等國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀的強(qiáng)勢(shì)崛起給國(guó)內(nèi)育種科學(xué)家提供了多元選擇：DNBseq主要基于DNBSEQ 技術(shù)（DNA納米球測(cè)序技術(shù)），結(jié)合聯(lián)合探針錨定聚合（cPAS）技術(shù)實(shí)現(xiàn)高通量測(cè)序；SURFseq基于“可逆末端終止測(cè)序法”技術(shù)路線，突破性推出TB級(jí)別桌面測(cè)序儀，縮短測(cè)序周期。目前，這兩種二代測(cè)序技在作物育種中具有廣泛的應(yīng)用，顯著提高育種效率、降低成本，并加速優(yōu)良品種的培育。

SURFseq&DNBSEQ平臺(tái)協(xié)助作物領(lǐng)域研究實(shí)例

DNBSEQ&SURFseq平臺(tái)協(xié)助作物領(lǐng)域測(cè)試結(jié)果展示

自10年前DNBSEQ測(cè)序技術(shù)的首款國(guó)產(chǎn)基因測(cè)序儀BGISEQ-500發(fā)布以來(lái)，DNBSEQ系列測(cè)序平臺(tái)已助力發(fā)表超1w+高質(zhì)量文章，建立了國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀的國(guó)際口碑，而近兩年來(lái)，SURFseq作為國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀的新秀，也以其低成本，通量高及優(yōu)秀的數(shù)據(jù)表現(xiàn)逐漸受到科研人員的認(rèn)可，以下是北京百邁客生物科技有限公司基于SURFseq測(cè)序平臺(tái)的測(cè)試數(shù)據(jù)結(jié)果展示

真邁SURFSeq 5000與主流進(jìn)口測(cè)序儀同批樣本測(cè)試中數(shù)據(jù)表現(xiàn)

每種文庫(kù)類型上機(jī)4-8個(gè)重復(fù)，下機(jī)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)質(zhì)量與基礎(chǔ)質(zhì)控結(jié)果，可以看出SURFseq 5000測(cè)序結(jié)果整體產(chǎn)出數(shù)據(jù)高質(zhì)量數(shù)據(jù)及有效數(shù)據(jù)比例更高，比對(duì)率覆蓋度等指標(biāo)與Nova X plus平臺(tái)相比基本持平，數(shù)據(jù)質(zhì)量穩(wěn)定可靠。

Trans及LncRNA文庫(kù)SURFseq 5000及Nova X plus平臺(tái)各重復(fù)樣本相關(guān)性統(tǒng)計(jì)，整體相關(guān)性在98%以上，數(shù)據(jù)分析結(jié)果與主流平臺(tái)結(jié)果一致性較高。

甲基化DMR分析結(jié)果顯示，SURFseq 5000 測(cè)序數(shù)據(jù)（Z007及Z008）鑒定DMR數(shù)要多于Nova X plus測(cè)序同批數(shù)據(jù)（B921-7及B921-8），且根據(jù)韋恩圖統(tǒng)計(jì)結(jié)果來(lái)看，SURFseq 5000 測(cè)序兩個(gè)重復(fù)樣本重合的DMR較Nova X plus測(cè)序的兩重復(fù)樣本更多，測(cè)序結(jié)果一致性更好。實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)顯示：SURFseq能夠完美復(fù)刻甚至優(yōu)于國(guó)際主流平臺(tái)的數(shù)據(jù)質(zhì)量。

優(yōu)種計(jì)劃啟動(dòng)!基因科技助力中國(guó)糧倉(cāng)升級(jí)

2025年，為了加速國(guó)產(chǎn)優(yōu)質(zhì)作物種質(zhì)培育及推動(dòng)優(yōu)化國(guó)內(nèi)糧食作物產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)，北京百邁客生物科技有限公司投放百萬(wàn)補(bǔ)貼正式啟動(dòng)【優(yōu)種計(jì)劃】! 該計(jì)劃將聚焦水稻、小麥、大豆等糧食作物及棉花，油菜等經(jīng)濟(jì)作物，基于優(yōu)質(zhì)國(guó)產(chǎn)平臺(tái)，覆蓋基因組學(xué)、群體研究、轉(zhuǎn)錄表觀組學(xué)等多種科研技術(shù)致力于構(gòu)建國(guó)產(chǎn)種質(zhì)資源基因數(shù)據(jù)庫(kù)，為培育高產(chǎn)、抗逆、優(yōu)質(zhì)新品種提供精準(zhǔn)導(dǎo)航。

一粒良種，萬(wàn)物生長(zhǎng)。讓我們用基因密碼解鎖豐收未來(lái)，共同筑牢大國(guó)糧倉(cāng)根基，掃描下方二維碼報(bào)名即有機(jī)會(huì)加入本次科研助農(nóng)計(jì)劃!

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【參考文獻(xiàn)】

1: Liu Z, Zhang J, Cai Y, Wang H, Luo M, Li J, Yu H, Meng X, Cao Y. Improving?Seed Shattering Resistance in Wild <i>O. alta</i> Rice with Mesoporous Silica?Nanoparticle Delivery Systems. Nano Lett. 2024 Sep 25;24(38):11823-11830. doi:10.1021/acs.nanolett.4c02297.

2:Hongyan Hou, Junxia Wu, Yu Zhang, Chenfei Lu, Wu Jiang, Yanghui Shen, Lanying Pan, Qingsong Shao, Aimin Lv,The cellulose synthase-like G3 (CslG3) gene mediates polysaccharide synthesis and drought stress response in Dendrobium catenatum,Scientia Horticulturae,https://doi.org/10.1016/j.scienta.2024.113514.

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